曾有3段婚姻的金庸一生有兩子兩女，分別為長子査傳俠、次子査傳倜、長女查傳詩及次女査傳訥。4名子女各有不同性格，金庸筆下小說皆有他們的影子。其中長子査傳俠天資聰穎，似足《天龍八部》中的「段譽」般，可惜於19歲時在美國讀書期間自殺身亡。
金庸的4名子女，均是他與第二任妻子朱玫所生；有指《倚天屠龍記》中的趙敏，原型人物正是朱玫，但兩人最終在1976年離婚。至於長子査傳俠則似足段譽，天資聰穎的他4歲時已能背誦《三字經》，6歲時能背《增廣賢文》，被稱讚為「小神童」。他14歲時寫過一篇文章指「人生大苦，了無意味」，有出世思想；金庸誇獎兒子「早慧」，但萬萬沒想到兒子會因「早慧」而斷送性命。1976年10月，正在美國讀大學一年級的查傳俠因為與女朋友在電話中吵架，一時衝動下自殺身亡，但亦有傳是與金庸與朱玫離婚有關。
長子的死令金庸深受打擊，此後開始鑽研佛學。5個月後，他在新版《倚天屠龍記》後記中寫道：「然而，張三豐見到張翠山自刎時的悲痛，謝遜聽到張無忌死訊時的傷心，書中寫得太也膚淺了，真實人生中不是這樣的。因為那時候我還不明白。」
至於次子查傳倜，外貌長得最似金庸。小時候不太聽話、成績不好的他性格有如《鹿鼎記》的主角「韋小寶」，後來被金庸送往英國讀書修讀會計，回港後協助父親打理出版社業務。其後，他對吃有濃厚興趣，更師承金庸好友、美食家蔡瀾，自號「八袋弟子」；他不但曾經營餐館，更到在深圳某高級酒樓做美食指導。2006年4月3日，當時44歲的他在銅鑼灣皇室堡HMV偷取價值115元的唱片，最終因盜竊罪被判罰款500元。
至於長女查傳詩貌美聰穎，據悉當年內地文革波及香港，金庸帶着妻兒到新加坡暫避。5歲時，她因發高燒導致雙耳失聰，金庸遂以「小聾女」稱呼她。不過，金庸好友、著名作家倪匡曾爆料，「小龍女」原型並非查傳詩，而是其幼女查傳訥。查傳訥最受金庸疼愛，畢業於樹仁書院的她為一名畫家，曾開畫展，丈夫是著名內科醫生吳維昌，兩人育有兩女一子。